二氧化碳培養箱設計了多種不同的裝置去減少和防止污染的發生，其主要途徑都是盡量減少微生物可以生長的區域和表面，并結合自動排除污染裝置來有效防止污染的產生。

CO2培養箱在使用過程中有時會伴有霉菌生長，為確保培養箱免受污染且保證儀器箱體內的生物清潔性，有些帶有紫外消毒功能的CO2培養箱;還有高效濾器能過濾培養箱內空氣，可過濾除去99.97%的0.3um以上的顆粒;此外，自動高溫熱空氣殺菌裝置能使箱內溫度達到高溫(如200℃)從而殺死所有污染微生物，甚至芽孢等耐高溫微生物，這些裝置對于細胞培養來說是更有安全保障的。

下面是二氧化碳培養箱使用前的注意事項:

1、二氧化碳培養箱未注水前不能打開電源開關，否則會損壞加熱元件。

2、培養箱運行數月后，水箱內的水因揮發可能減少，當低水位指示燈(WLow12)亮時應補充加水。先打開溢水管，用漏斗接橡膠管從注水孔補充加水使低水位指示燈熄滅，再計量補充加水(CP-ST200A加水1800ml，CP-ST100A加水1200ml)，然后堵塞溢水孔。

3、二氧化碳培養箱可以做高精度恒溫培養箱使用，這時須關閉CO2控制系統。

4、因為CO2傳感器是在飽和濕度下校正的，因此加濕盤必須時刻裝有滅菌水。

5、當顯示溫度超過置定溫度1℃時，超溫報警指示燈(OverTemp7)亮，并發出尖銳報警聲，這時應關閉電源30分鐘;若再打開電源(溫控)開關(Power20)仍然超溫，則應關閉電源并報維修人員。

6、鋼瓶壓力低于0.2MPa時應更換鋼瓶。

7、盡量減少打開玻璃門的時間。

8、如果二氧化碳培養箱長時間不用，關閉前必須清除工作室內水分，打開玻璃門通風24小時后再關閉。

9、清潔二氧化碳培養箱工作室時，不要碰撞傳感器和攪拌電機風輪等部件。

10、拆裝工作室內支架護罩，必須使用隨機專用扳手，不得過度用力。

11、搬運培養箱前必須排除箱體內的水。排水時，將橡膠管緊套在出水孔上，使管口低于儀器，輕輕吸一口，放下水管，水即虹吸流出。

12、搬運二氧化碳培養箱前應拿出工作室內的擱板和加濕盤，防止碰撞損壞玻璃門。

13、搬運培養箱時不能倒置，同時一定不要抬箱門，以免門受損。