GenePix 4100A 微陣列基因芯片掃描儀
本序列掃描儀由獲獎(jiǎng)的光學(xué)，電子和軟件設(shè)計(jì)等幾部分組成。因其價(jià)格區(qū)間和臺(tái)式小巧的設(shè)計(jì)，使它非常適合個(gè)人實(shí)驗(yàn)室使用。分辨率 5-100 微米/Pixel，且用戶可調(diào)，8個(gè)濾光片位置的濾光片輪，2 個(gè)激光選擇，順序掃描。
產(chǎn)品概述：
GenePix 4100A 是 MD 公司推出基礎(chǔ)款微陣列基因芯片掃描儀，采用非共聚焦光路，在兩個(gè)波長(zhǎng)下（532nm/635nm）分別掃描讀取數(shù)據(jù)；配有 2個(gè)半導(dǎo)體激光器，激光器輸出功率固定，并利用自動(dòng)溫度控制和自動(dòng)功率控制反饋回路保持輸出功率穩(wěn)定；分辨率在 5～100 μm 范圍內(nèi)可調(diào)，分辨率為5 μm 時(shí)掃描時(shí)間為12分鐘，分辨率為10 μm 時(shí)掃描時(shí)間為5分鐘；可掃描 25 mm×75 mm 尺寸的標(biāo)準(zhǔn)生物芯片，用戶可定義的掃描面積為 22 mm ×73 mm；光電倍增管測(cè)量，16位數(shù)字化信號(hào)輸出；硬件和軟件高度集成，GenePix 4100A 微陣列基因芯片掃描儀具有基因芯片掃描儀所有的特質(zhì)：如超高靈敏性，可靠性和易操作性。實(shí)惠的價(jià)格和緊湊設(shè)計(jì)使得它更適合在小實(shí)驗(yàn)室中使用。
主要特點(diǎn)：
1.采用非共聚焦光路設(shè)計(jì)：GenePix 4100A 具有大景深檢測(cè)能力，可以在各種微陣列芯片表面收集更多的光學(xué)信號(hào)，同時(shí)也能夠避免附近雜散光的干擾。
2.內(nèi)置多位的濾光輪，可大大提高熒光染料檢測(cè)的靈活性：GenePix 4100A 中設(shè)計(jì)有一個(gè)8位的發(fā)射濾光片轉(zhuǎn)輪，標(biāo)配有紅色和綠色濾光片。根據(jù)需要還可以再裝6個(gè)濾光片，提高了靈活性。
3.動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)激光光源：GenePix 4100A 采用的激光器，配合了的強(qiáng)度校正系統(tǒng)，保證在圖像中的所有像素點(diǎn)具有相等的曝光效率。內(nèi)置所有激光器均具有自動(dòng)校正功能，可以動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)激光器微小的波動(dòng)，大大提高了信號(hào)噪聲比，保證獲取的數(shù)據(jù)具有高度重復(fù)性。
4.PMT 自動(dòng)平衡技術(shù)以及分辨率調(diào)節(jié)技術(shù)于一體：GenePix 4100A 支持用戶在 5-100 μm范圍內(nèi)隨意調(diào)節(jié)其分辨率來(lái)獲取數(shù)據(jù)。可針對(duì)具體實(shí)驗(yàn)的需求優(yōu)化圖像分辨率和文件的大小，并且具有自動(dòng)調(diào)節(jié) PMT 增益的功能，可簡(jiǎn)便、快速對(duì)信號(hào)強(qiáng)度和通道的平衡進(jìn)行優(yōu)化。
應(yīng)用領(lǐng)域：
基因芯片技術(shù)：DNA基因表達(dá)、陣列比較基因組雜交 (aCGH)、染色質(zhì)免疫沉淀 (ChIP-on-Chip)、拷貝數(shù)變化 (CNV)、DNA 甲基化、SNP 分型、雜交測(cè)序、RNAi 和 microRNA 檢測(cè)
蛋白芯片技術(shù)：蛋白質(zhì)組學(xué)、ELISA、抗體芯片、抗原芯片、蛋白-蛋白結(jié)合、蛋白-細(xì)胞相互作用、組織微陣列、細(xì)胞微陣列、碳水化合物微陣列、化合物微陣列、微流控芯片、納米技術(shù)微陣列
實(shí)驗(yàn)舉例：
正常情況下，人類基因組“垃圾”序列的 CpG 二核苷酸相對(duì)稀少，并且總是處于甲基化狀態(tài)，與之相反，人類基因組中大小為100-1000 bp 左右，富含 CpG 二核苷酸的 CpG 島則總是處于未甲基化狀態(tài)，并且 CpG 島常位于轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)附近，與56%的人類基因組編碼基因相關(guān)，因此基因轉(zhuǎn)錄區(qū) CpG 島的甲基化狀態(tài)的研究就顯得十分重要。利用芯片掃描儀可分析測(cè)試 DNA 的甲基化水平并與參考 DNA 進(jìn)行比較。
