GelCompar II 是一個專門針對一維電泳圖譜進行分析和處理，并在此基礎上進行親緣關系、聚類分析、數理統計分析及鑒定的標準軟件包。

GelCompar II 是一個專門針對一維電泳圖譜進行分析和處理，并在此基礎上進行親緣關系、聚類分析、數理統計分析及鑒定的標準軟件包。

它包含以下功能模塊：

GelCompar Basic Software:

凝膠圖像的處理和歸一化：包含峰的標準化和峰的搜索功能。分子量計算和峰的定量；條帶匹配和多態性分析。

Tree and Network Inference: 

基于UPGMA、Single Linkage、Complete Linkage、Neighbor Joining、Ward和Parsimony等統計學方法進行聚類分析，并可以顯示進化樹上的錯誤聚類和重要的分支。

Identification and Library Manager:

基于庫和統計學方法對未知樣品進行鑒定的工具。

Dimensioning Techniques:

包含PCA和MDS方法的多維技術，可以產生散點圖和圖表等各種形式的輸出文件。

Database Sharing Tools:

能生成以Oracle、Microsoft  Access和SQL為Server的數據庫，并可以和BioNumerics的Serve實現數據共享。